全自動洗瓶機可以對實驗室常用實驗器皿(錐形瓶、燒杯、試管、移液管、試劑瓶、燒瓶、培養皿等)進行清洗、消毒、干燥全自動處理。
全自動洗瓶機由于需要頻繁的接觸酸和堿，需要對各種化學物質有一定的耐受性，通常選擇高性能的不銹鋼材料制作。盡管如此，定期對設備進行保養仍然是必須的。這樣可以確保設備隨時處于可用狀態，延長設備的使用壽命。
全自動洗瓶機有些頻繁轉動的部件，如蠕動泵及其軟管、循環泵等需要定期進行檢查和更換配件，以確保清洗劑可以按照設定的數值正常吸入，設備正常運轉。長期停機不用也有可能會導致某些閥門失效或者雜質堵塞管道等。保養工作可以由內部的設備工程師完成，也可以外包給設備廠商完成。對自動清洗機進行定期的保養，有利于長期的、高效的使用設備，發揮設備的最大價值。
由于全自動洗瓶機的循環、噴淋等作用，普通的清洗劑含有表面活性劑，會形成大量的泡沫。這些泡沫一方面會溢出來，另一方面也有可能導致循環泵的損壞，所以全自動洗瓶機只能使用無泡沫或低泡沫的清洗劑。
專用的清洗劑不僅含有堿或酸，還有螯合劑、絡合劑等多種活性物質。通過這些活性物質的協同作用更好地溶解和分散殘留物。此外，清洗溶液不僅要有去除殘留物的清洗能力，還不能損壞設備的表面和管路。設備廠商在推薦清洗劑時，都經過細致的測試與評估，確認滿足各方面的條件才可以使用。
如果清洗劑自己配制，由于不了解設備的材料特性，很容易導致設備損壞，將會得不償失。選擇穩定高質量的專用清洗劑，不僅能夠發揮設備的潛力，延長全自動洗瓶機的使用壽命，還能很大程度的確保清洗工藝的穩定性和可重復性。
